จากพระราชดำริและพระราโชวาท ของ สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ในเรื่อง ของสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน ซึ่งมีความสอดคล้อง กับงานปกติ ในเรื่องของการเรียนการสอน และ ในเรื่องของการปฏิรูปการศึกษา ซึ่งเน้นให้รักเรียน เป็นศูนย์กลาง ดังนั้น ทางโรงเรียนฯ จึงได้มี การประชุมหารือ และเห็นพ้อง ต้องกัน ที่จะร่วมสนอง พระราชดำริฯ ดำเนินงานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน และได้สมัครเป็นสมาชิก สวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน โครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืช อันเนื่องมาจากพระราชดำริฯ
โรงเรียนสตรีนครสวรรค์ได้เข้าร่วมโครงการสนองพระราชดำริฯ และได้รับอนุญาต ให้เป็นโรงเรียนสมาชิกสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน ตั้งแต่ปี พ.ศ. ๒๕๓๘ หมายเลขรหัส ๗-๖๐๐๐๐-๑ โรงเรียนได้สนองพระราชดำริฯ ดำเนินการจัดกิจกรรม การเรียนรู้ตามแนวดำเนินการ ของงานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน มาตลอด ได้รับ “บัตร” การรับรอง และคุณธรรม ดังนี้
ปี พ.ศ. ๒๕๔๓ ได้รับพระราชทาน ป้ายสนองพระราชดำริในงานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน (๑๒ ตุลาคม ๒๕๔๓ )
ปี พ.ศ. ๒๕๔๖ ได้รับพระราชทานเกียรติบัตรขั้นที่ ๑ เกียรติบัตรแห่งความมุ่งมั่น อนุรักษ์ สรรพสิ่ง สรรพชีวิต ด้วยไวพจน์แห่งจิตสำนึก ของเยาวชน ( ๙ พฤษภาคม ๒๕๔๖)
ปี พ.ศ. ๒๕๕๒ ได้รับประกาศ ปีพุทธศักราช ๒๕๕๒ - ๒๕๕๓ ที่แสดงว่าโรงเรียนสตรีนครสวรรค์ มีความมุ่งมั่น พัฒนาสถานศึกษา ในวิถีนำไปสู่การเป็นสถานอบรม สั่งสอนเบ็ดเสร็จ เพื่อ บุคลกร มีวิทยาการ ปัญญา และภูมิปัญญา เข้าถึงผลประโยชน์แท้ บนฐาน งานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน ( ๑๙ ตุลาคม ๒๕๕๒ )
ปี พ.ศ. ๒๕๕๔ ได้รับพระราชทานเกียรติบัตรขั้นที่ ๒ เกียรติบัตรแห่งการเข้าสู่สถานภาพสถานศึกษาอบรมสั่งสอนเบ็ดเสร็จบนฐานงานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน
( ๑ พฤศจิกายน ๒๕๕๔ )